• 电子与计算机工程副教授
  • 计算机科学与工程学院
杨沈

教育背景

  • 博士,系统工程,波士顿大学- 2008
  • 2002年,中国科学技术大学自动化专业,工学学士

研究兴趣

  • 建模生物分子、系统和数据的算法。

    • 算法:
      • 优化和机器学习
      • 系统与控制
    • 应用程序:
      • 蛋白质对接和蛋白质与药物设计
      • 系统与合成生物学
      • 组学

获奖荣誉

  • 最大化早期研究者研究奖(MIRA),美国国立卫生研究院普通医学科学研究所,2017年
  • 教师早期职业发展(Career)奖,国家科学基金,2020

选定的出版物

  • You and Y Shen(2022)。“基于交叉模态和自监督的蛋白质包埋方法的研究”,生物信息学报,38(增刊2):368 - 374。
  • M Karimi, S朱,曹毅,沈毅(2020)。“基于导向条件Wasserstein生成对抗网络的蛋白质新折叠设计”,化学信息与建模60(12):5667-5681。
  • 曹毅,沈毅(2020)。“基于Bayesian主动学习的蛋白质对接优化与不确定性量化”,化学理论与计算16(8):5334-5347。
  • 游颖,陈涛,王志,沈毅(2019)。“什么时候自我监督有助于绘制卷积网络?”国际机器学习会议(ICML), pp. 10871-10880。
  • 曹毅,陈涛,王忠,沈毅(2019)。“学习在群体中优化”,神经信息处理系统进展(NeurIPS) 32: 15018-15028。
  • M Karimi, Wu D, Wang Z, Shen Y(2019)。“基于卷积神经网络的复合蛋白亲和力的深度学习”,生物信息学35(18):3329-3338。
  • M Karimi, Y Shen(2018)。“一种高效精确的多态蛋白设计算法”,生物信息学34(18):811- 820。