- 电子与计算机工程副教授
- 计算机科学与工程学院
- 联合学院:计算机工程
- 电话:979-862-1694
- 传真:979-845-6259
- 电子邮件:yshen@tamu.edu
- 办公室:网络215年我
- 网站:个人网站
教育背景
- 博士,系统工程,波士顿大学- 2008
- 2002年,中国科学技术大学自动化专业,工学学士
研究兴趣
建模生物分子、系统和数据的算法。
- 算法:
- 优化和机器学习
- 系统与控制
- 应用程序:
- 蛋白质对接和蛋白质与药物设计
- 系统与合成生物学
- 组学
- 算法:
获奖荣誉
- 最大化早期研究者研究奖(MIRA),美国国立卫生研究院普通医学科学研究所,2017年
- 教师早期职业发展(Career)奖,国家科学基金,2020
选定的出版物
- You and Y Shen(2022)。“基于交叉模态和自监督的蛋白质包埋方法的研究”,生物信息学报,38(增刊2):368 - 374。
- M Karimi, S朱,曹毅,沈毅(2020)。“基于导向条件Wasserstein生成对抗网络的蛋白质新折叠设计”,化学信息与建模60(12):5667-5681。
- 曹毅,沈毅(2020)。“基于Bayesian主动学习的蛋白质对接优化与不确定性量化”,化学理论与计算16(8):5334-5347。
- 游颖,陈涛,王志,沈毅(2019)。“什么时候自我监督有助于绘制卷积网络?”国际机器学习会议(ICML), pp. 10871-10880。
- 曹毅,陈涛,王忠,沈毅(2019)。“学习在群体中优化”,神经信息处理系统进展(NeurIPS) 32: 15018-15028。
- M Karimi, Wu D, Wang Z, Shen Y(2019)。“基于卷积神经网络的复合蛋白亲和力的深度学习”,生物信息学35(18):3329-3338。
- M Karimi, Y Shen(2018)。“一种高效精确的多态蛋白设计算法”,生物信息学34(18):811- 820。